1）操作前准备：局部麻醉、心电血压及脉搏血氧饱和度的监测。
2）完成气管支气管分支的观察，然后进行BAL，最后进行活检或刷检，这样操作可减少医源性出血对肺泡灌洗液中细胞和蛋白成分的影响。
3）BAL的部位：通常选择影像学表现最显著的部位；对于病灶局限者选择病变肺段BAL；对于弥漫性病变，右中叶（B4或B5）和左舌叶是最佳的部位医学|教育网整理。
4）BAL的液体注入：支气管镜置入并崁顿在选定的肺段，当气管镜崁顿于支气管的第三或第四级亚段，可获得最佳的肺泡灌洗回收量。注入37oC或室温无菌生理盐水。通常经支气管镜的活检孔用注射器注入灌洗液，每次注入20～60ml（常规进行4～5次），直到总共灌洗100～300ml。灌洗液过少40%；存活细胞占95%以上；红细胞<10%（除外创伤/出血因素），上皮细胞<3%～5%；涂片细胞形态完整，无变形，分布均匀。
7）BAL与支气管冲洗和全肺灌洗的不同：冲洗液主要来自于大气道，通常要求注入盐水量为10～30ml医学|教育网整理，目的是对病灶肺段进行细菌学或脱落细胞等检查。全肺灌洗是用于治疗肺泡蛋白沉积症的一种独特的治疗方法，需要在全身麻醉下，通过双腔气管内导管注入大量（30～50L）的无菌盐水，用于清洗肺泡蛋白沉积症患者的一侧全肺。
