B股的清算交割由于涉及境内、境外以及委托管银行，因此程序较为复杂，以上交所的清算交割程序为例，大致有以下六个步骤：
1、登记结算公司于证交所每日交易闭市后，根据证交所提供的成交资料，编制各结算会员当日成交的"结算交收通知书"，该通知书于T+0下午4时后送结算会员。T+X日："T"指证交所的交易日，"X日"指交易后的营业日(上海和美国的工作日)
2、结算会员接到"结算交收通知书"后，境内经纪商和境外代理商最迟须于T+1日下午3:00之前，托管银行最迟须于T+2日中午12:00之前，向登记结算公司发出"结算交收指令"。
3、登记结算公司将于T+2日下午3:00之前完成所有交收指令的核对，如交收指令核对无误，登记结算公司将据此进行交收；如交收指令核对有误，登记结算公司将及时通知有关的结算会员
4、买方结算会员须于T+3日中午12:00之前，将应付款项足额汇入登记结算公司在代理银行开立的资金帐户。
5、对卖方结算会员，登记结算公司于T+3下午3:00，根据其"结算交收指令"指定的银行帐号向代理银行发出汇款指令，并同时实施股权变更和股票转移，按卖方客户沽出股票的数量，调整其股权登记和"股票存管帐户"的金额
6、登记结算公司于交收完成的当日下午5:00之后，向结算会员发出"交收确认书"。同时，按投资者的每笔委托编制"交收凭证"，每周向结算会员邮寄一次"交收凭证"，投资者可在其结算会员处领取自己的"交收凭证"
